年降雨量在1500-2000毫米之间且分布均匀的条件下百香果生长**，商品性发展种植地区的年降雨量不宜少于1000毫米。缺水减少节的数量和节间长度，从而减少了全蔓的伸展长度，开花数量减少，产量不高。缺水茎干变细，卷须变短，叶片、花朵变小，侧根较少，叶片褪色，新生腋梢**，叶片边缘和顶端出现坏死。缺水引起P、Ca、Mn、Fe、Zm和B的含量下降，影响百香果养分吸收和新陈代谢，从而影响植株正常生长发育。
水分过多（如浸水），湿度大，容易引起病害，如茎基腐病等。百香果实生苗根部浸水4-6天后，因为缺乏氧气根系呼吸受影响，地上部生长受控制，造成叶柄上偏生长，叶片老化、落叶，茎基部肿大、松裂，生出点状白色松软组织，并长出不定根。夏季高温期浸水其伤害尤重，而冬季浸水其症状较轻。故百香果应种在排灌良好的地方。
